TP53 panel
TP53 panel- TP53 gén (SNP/indel detekció a TP53 génben)
TP53 panel- TP53 gén
TP53 (exon2-12)
TP53 gén
(SNP/indel detekció a TP53 génben)
A TP53 a legismertebb tumorszuppresszor gén, termékét, a p53 fehérjét a genom őrének is nevezik. A p53 fehérje különböző sejtkárosodásra adott válaszban játszik szerepet, szabályozza többek között a sejtciklust, az apoptózist, a sejtöregedést, a DNS javítást, illetve a metabolizmust.
A malignus betegségek kb. 50%-ban fordul elő eltérés a TP53 génben. A 32,8 kb hosszúságú gén mind a 11 exonjában előfordulhatnak patogén mutációk.
Az iwCLL (Nemzetközi CLL Munkacsoport) valamennyi krónikus lymphocytás leukémiás beteg esetében terápia előtt TP53 mutációanalízist javasol. Akut myeloid leukémia, valamint myelodysplasias neoplázia eseteiben a nemzetközi ajánlások javasolják a TP53 mutáció vizsgálatát.
KRÓNIKUS LYMPHOCYTÁS LEUKÉMIA
A krónikus lymphocytás leukémia (CLL) a leggyakoribb felnőttkori leukémia, genetikailag heterogén betegség. A diagnóziskor a betegek 5-15%-ában mutatható ki TP53 mutáció, terápia-refrakter esetekben ez az arány 40-50% is lehet. CLL esetében a legfontosabb prognosztikus és prediktív genetikai eltérés a TP53 mutáció; kedvezőtlen kórlefolyással, és a kemoimmunoterápia sikertelenségével társul. Az esetek kb. felében szubklonális TP53 mutáció van jelen, melynek klinikai jelentősége számos tanulmány alapján azonos a klonális mutációk jelentőségével, azonban kimutatásuk hagyományos molekuláris módszerekkel nem megbízható; azonosításukhoz megfelelő érzékenységű NGS vizsgálat szükséges.
AKUT LEUKÉMIÁK
Az akut myeloid leukémia (AML) és az akut lymphoblastos leukémia (ALL) rossz prognózisú, nagy malignitású, genetikailag heterogén betegség felnőttkorban. TP53 eltérés az akut leukémiák 5-15%-ában fordul elő, kedvezőtlen kórlefolyással társul. Minden AML és ALL esetében javasolt a TP53 mutációanalízis elvégzése.
MYELODYSPLASIAS NEOPLÁZIÁK
A myelodysplasias neopláziák (MDS) a csontvelői őssejtek betegségei, melyek elégtelen vérképzéshez vezetnek, növelik az akut myeloid leukémia kialakulásának kockázatát. A betegség előfordulása az életkor előrehaladtával nő, 60 év felett 75/100.000 gyakoriságra lehet számítani. A TP53 mutáció kedvezőtlen kórlefolyású MDS-altípust határoz meg, így vizsgálata javasolt MDS diagnózisa esetében.
BETEGSÉGCSOPORTHOZ TARTOZÓ PANELEK
Solid tumor panel MSI-vel
(SNP/indel detekció 40 releváns génben, CNA, fúziók és MSI)
SNV/indel: AKT1(exon3-4), ALK(exon21-25), BRAF(exon 11,12,15,18), CTNNB1(exon 3), DDR2(exon 5,8,13-18), EGFR(exon 3,7,12,14,18-22), ERBB2(exon 1-27), ESR1(exon 6,9), FGFR1(exon 5,6,13,15), FGFR2(exon 3,5-9,12-16,18), FGFR3(exon 3,7-15,17), FGFR4(exon 3,6,9,10,12,13,15,16), HRAS(exon 2-4), IDH1(exon 4), IDH2(exon 4), KEAP1(exon 2-6), KIT(exon 9,11,13,14,17,18), KRAS(exon 2-4), MAP2K1(exon 2,3,6), MET(exon 3,9,12,14,15,20,21), NFE2L2(exon 2), NRAS(exon 2-4), NTRK1(exon 14,15), NTRK2(exon 18,19), NTRK3(exon 16,17), PDGFRA(exon 12, 14, 18), PIK3CA(exon 2,3,5,6,8-10,14,21), POLE(exon 3-14,19), PTEN(teljes kódoló régió), RB1(exon 1-27), RET(exon 5,6,8,10,11,13-16), ROS1(exon 36-38, 40,41), STK11(exon 1-9), TP53(exon 2-11)
CNV: CDK4, ERBB2, MET, MYC, NKX2-1,
Fúzió: ALK, FGFR1, FGFR2, FGFR3, METex14 skipping, NRG1, NTRK1, NTRK2, NTRK3, RET, ROS1
Kiterjesztett solid tumor panel
(TMB, MSI, SNP/indel detekció 523 releváns génben, CNV és fúziók)
GÉNEK LISTÁJA
A vizsgált gének listája itt található: https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/gene_lists/gene_list_trusight_oncology_500.xlsx
SNV/indel: ABL1, ABL2, ACVR1, ACVR1B, AKT1, AKT2, AKT3, ALK, ALOX12B, ANKRD11, ANKRD26, APC, AR, ARAF, ARFRP1, ARID1A, ARID1B, ARID2, ARID5B, ASXL1, ASXL2, ATM, ATR, ATRX, AURKA, AURKB, AXIN1, AXIN2, AXL, B2M, BAP1, BARD1, BBC3, BCL10, BCL2, BCL2L1, BCL2L11, BCL2L2, BCL6, BCOR, BCORL1, BCR, BIRC3, BLM, BMPR1A, BRAF, BRCA1, BRCA2, BRD4, BRIP1, BTG1, BTK, C11orf30, CALR, CARD11, CASP8, CBFB, CBL, CCND1, CCND2, CCND3, CCNE1, CD274, CD276, CD74, CD79A, CD79B, CDC73, CDH1, CDK12, CDK4, CDK6, CDK8, CDKN1A, CDKN1B, CDKN2A, CDKN2B, CDKN2C, CEBPA, CENPA, CHD2, CHD4, CHEK1, CHEK2, CIC, CREBBP, CRKL, CRLF2, CSF1R, CSF3R, CSNK1A1, CTCF, CTLA4, CTNNA1, CTNNB1, CUL3, CUX1, CXCR4, CYLD, DAXX, DCUN1D1, DDR2, DDX41, DHX15, DICER1, DIS3, DNAJB1, DNMT1, DNMT3A, DNMT3B, DOT1L, E2F3, EED, EGFL7, EGFR, EIF1AX, EIF4A2, EIF4E, EML4, EP300, EPCAM, EPHA3, EPHA5, EPHA7, EPHB1, ERBB2, ERBB3, ERBB4, ERCC1, ERCC2, ERCC3, ERCC4, ERCC5, ERG, ERRFI1, ESR1, ETS1, ETV1, ETV4, ETV5, ETV6, EWSR1, EZH2, FAM123B, FAM175A, FAM46C, FANCA, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, FAS, FAT1, FBXW7, FGF1, FGF10, FGF14, FGF19, FGF2, FGF23, FGF3, FGF4, FGF5, FGF6, FGF7, FGF8, FGF9, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, FH, FLCN, FLI1, FLT1, FLT3, FLT4, FOXA1, FOXL2, FOXO1, FOXP1, FRS2, FUBP1, FYN, GABRA6, GATA1, GATA2, GATA3, GATA4, GATA6, GEN1, GID4, GLI1, GNA11, GNA13, GNAQ, GNAS, GPR124, GPS2, GREM1, GRIN2A, GRM3, GSK3B, H3F3A, H3F3B, H3F3C, HGF, HIST1H1C, HIST1H2BD, HIST1H3A, HIST1H3B, HIST1H3C, HIST1H3D, HIST1H3E, HIST1H3F, HIST1H3G, HIST1H3H, HIST1H3I, HIST1H3J, HIST2H3A, HIST2H3C, HIST2H3D, HIST3H3, HNF1A, HNRNPK, HOXB13, HRAS, HSD3B1, HSP90AA1, ICOSLG, ID3, IDH1, IDH2, IFNGR1, IGF1, IGF1R, IGF2, IKBKE, IKZF1, IL10, IL7R, INHA, INHBA, INPP4A, INPP4B, INSR, IRF2, IRF4, IRS1, IRS2, JAK1, JAK2, JAK3, JUN, KAT6A, KDM5A, KDM5C, KDM6A, KDR, KEAP1, KEL, KIF5B, KIT, KLF4, KLHL6, KRAS, LAMP1, LATS1, LATS2, LMO1, LRP1B, LYN, LZTR1, MAGI2, MALT1, MAP2K1, MAP2K2, MAP2K4, MAP3K1, MAP3K13, MAP3K14, MAP3K4, MAPK1, MAPK3, MAX, MCL1, MDC1, MDM2, MDM4, MED12, MEF2B, MEN1, MET, MGA, MITF, MLH1, MLL, MLLT3, MPL, MRE11A, MSH2, MSH3, MSH6, MST1, MST1R, MTOR, MUTYH, MYB, MYC, MYCL1, MYCN, MYD88, MYOD1, NAB2, NBN, NCOA3, NCOR1, NEGR1, NF1, NF2, NFE2L2, NFKBIA, NKX2-1, NKX3-1, NOTCH1, NOTCH2, NOTCH3, NOTCH4, NPM1, NRAS, NRG1, NSD1, NTRK1, NTRK2, NTRK3, NUP93, NUTM1, PAK1, PAK3, PAK7, PALB2, PARK2, PARP1, PAX3, PAX5, PAX7, PAX8, PBRM1, PDCD1, PDCD1LG2, PDGFRA, PDGFRB, PDK1, PDPK1, PGR, PHF6, PHOX2B, PIK3C2B, PIK3C2G, PIK3C3, PIK3CA, PIK3CB, PIK3CD, PIK3CG, PIK3R1, PIK3R2, PIK3R3, PIM1, PLCG2, PLK2, PMAIP1, PMS1, PMS2, PNRC1, POLD1, POLE, PPARG, PPM1D, PPP2R1A, PPP2R2A, PPP6C, PRDM1, PREX2, PRKAR1A, PRKCI, PRKDC, PRSS8, PTCH1, PTEN, PTPN11, PTPRD, PTPRS, PTPRT, QKI, RAB35, RAC1, RAD21, RAD50, RAD51, RAD51B, RAD51C, RAD51D, RAD52, RAD54L, RAF1, RANBP2, RARA, RASA1, RB1, RBM10, RECQL4, REL, RET, RFWD2, RHEB, RHOA, RICTOR, RIT1, RNF43, ROS1, RPS6KA4, RPS6KB1, RPS6KB2, RPTOR, RUNX1, RUNX1T1, RYBP, SDHA, SDHAF2, SDHB, SDHC, SDHD, SETBP1, SETD2, SF3B1, SH2B3, SH2D1A, SHQ1, SLIT2, SLX4, SMAD2, SMAD3, SMAD4, SMARCA4, SMARCB1, SMARCD1, SMC1A, SMC3, SMO, SNCAIP, SOCS1, SOX10, SOX17, SOX2, SOX9, SPEN, SPOP, SPTA1, SRC, SRSF2, STAG1, STAG2, STAT3, STAT4, STAT5A, STAT5B, STK11, STK40, SUFU, SUZ12, SYK, TAF1, TBX3, TCEB1, TCF3, TCF7L2, TERC, TERT, TET1, TET2, TFE3, TFRC, TGFBR1, TGFBR2, TMEM127, TMPRSS2, TNFAIP3, TNFRSF14, TOP1, TOP2A, TP53, TP63, TRAF2, TRAF7, TSC1, TSC2, TSHR, U2AF1, VEGFA, VHL, VTCN1, WISP3, WT1, XIAP, XPO1, XRCC2, YAP1, YES1, ZBTB2, ZBTB7A, ZFHX3, ZNF217, ZNF703, ZRSR2
CNV: AKT2, ALK, AR, ATM, BRAF, BRCA1, BRCA2, CCND1, CCND3, CCNE1, CDK4, CDK6, CHEK1, CHEK2, EGFR, ERBB2, ERBB3, ERCC1, ERCC2, ESR1, FGF1, FGF10, FGF14, FGF19, FGF2, FGF23, FGF3, FGF4, FGF5, FGF6, FGF7, FGF8, FGF9, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, JAK2, KIT, KRAS, LAMP1, MDM2, MDM4, MET, MYC, MYCL1, MYCN, NRAS, NRG1, PDGFRA, PDGFRB, PIK3CA, PIK3CB, PTEN, RAF1, RET, RICTOR, RPS6KB1, TFRC
Fúzió: ABL1, AKT3, ALK, AR, AXL, BCL2, BRAF, BRCA1, BRCA2, CDK4, CSF1R, EGFR, EML4, ERBB2, ERG, ESR1, ETS1, ETV1, ETV4, ETV5, EWSR1, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, FLI1, FLT1, FLT3, JAK2, KDR, KIF5B, KIT, MET, MLL, MLLT3, MSH2, MYC, NOTCH1, NOTCH2, NOTCH3, NRG1, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PAX3, PAX7, PDGFRA, PDGFRB, PIK3CA, PPARG, RAF1, RET, ROS1, RPS6KB1, TMPRSS2
Metilációs profil
A vizsgálat során MethylationEPIC v2.0 BeadChip (Illumina) microarray kerül felhasználásra, melynek során több, mint 900.000 biológiailag releváns CpG hely metilációjáról gyűjtünk kvantitatív adatot.
TP53 panel
SNP/indel detekció a
gén2-11 exonjaiban
TP53 (teljes kódoló régió)
Solid tumor panel MSI nélkül
(SNP/indel detekció 52 releváns
génben, CNA és fúziók)
SNV, hotspot: AKT1 AKT2 AKT3 ALK AR ARAF AXL BRAF BTK CBL CCND1 CDK4 CDK6 CHEK2 CSF1R CTNNB1 DDR2 EGFR ERBB2 ERBB3 ERBB4 ERCC2 ESR1 EZH2 FGFR1 FGFR2 FGFR3 FGFR4 FLT3 FOXL2 GATA2 GNA11 GNAQ GNAS H3F3A HIST1H3B HNF1A HRAS IDH1 IDH2 JAK1 JAK2 JAK3 KDR KIT KNSTRN KRAS MAGOH MAP2K1 MAP2K2 MAP2K4 MAPK1 MAX MDM4 MED12 MET MTOR MYC MYCN MYD88 NFE2L2 NRAS NTRK1 NTRK2 NTRK3 PDGFRA PDGFRB PIK3CB PIK3CA PPP2R1A PTPN11 RAC1 RAF1 RET RHEB RHOA ROS1 SF3B1 SMAD4 SMO SPOP SRC STAT3 TERT TOP1 U2AF1 XPO1
SNV, teljes gén: ARID1A ATM ATR ATRX BAP1 BRCA1 BRCA2 CDK12 CDKN1B CDKN2A CDKN2B CHEK1 CREBBP FANCA FANCD2 FANCI FBXW7 MLH1 MRE11 MSH6 MSH2 NBN NF1 NF2 NOTCH1 NOTCH2 NOTCH3 PALB2 PIK3R1 PMS2 POLE PTCH1 PTEN RAD50 RAD51 RAD51B RAD51C RAD51D RNF43 RB1 SETD2 SLX4 SMARCA4 SMARCB1 STK11 TP53 TSC1 TSC2
CNV: AKT1 AKT2 AKT3 ALK AXL AR BRAF CCND1 CCND2 CCND3 CCNE1 CDK2 CDK4 CDK6 EGFR ERBB2 ESR1 FGF19 FGF3 FGFR1 FGFR2 FGFR3 FGFR4 FLT3 IGF1R KIT KRAS MDM2 MDM4 MET MYC MYCL MYCN NTRK1 NTRK2 NTRK3 PDGFRA PDGFRB PIK3CB PIK3CA PPARG RICTOR TERT
Fúzió: AKT2 ALK AR AXL BRCA1 BRCA2 BRAF CDKN2A EGFR ERBB2 ERBB4 ERG ESR1 ETV1 ETV4 ETV5 FGFR1 FGFR2 FGFR3 FGR FLT3 JAK2 KRAS MDM4 MET MYB MYBL1 NF1 NOTCH1 NOTCH4 NRG1 NTRK1 NTRK2 NTRK3 NUTM1 PDGFRA PDGFRB PIK3CA PRKACA PRKACB PTEN PPARG RAD51B RAF1 RB1 RELA RET ROS1 RSPO2 RSPO3 TERT
HRD Panel
BRCA1, BRC2 gének és 24 000 SNP
Kiterjesztett solid tumor panel liquid biopszia esetén
(TMB, MSI, SNP/indel detekció 523 releváns génben, CNV és fúziók)
GÉNEK LISTÁJA
A vizsgált gének listája itt található: https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/gene_lists/gene_list_trusight_oncology_500.xlsx
SNV/indel:
CNV:
Fúzió:
Myeloid és lymphoid neoplázia panel
(SNP/indel detekció 114 releváns génben)
ABL1, ABL2, AKT1, AKT2, ARID1A, ASMTL, ASMTL, ASXL1, ASXL2, ASXL3, ATRX, BCL11B, BCL2, BCL2A1, BCL2L2, BCL6B, BCL9, BCL9L, BCORL1, BRAF, BTK, C9orf53;CDKN2A, CBL, CCND3, CDKN2A, CDKN2B, CLSTN1;PIK3CD, CNOT3, CREBBP, CRLF2, CTCF, CSF3R, DDX3X, DNM2, DNMT1, DNMT3A, DOT1L, EBF1, EP300, ETV6, EZH2, FBXW7, FLT3, GATA1, GATA3, GNAO1, IDH1, IDH2, IKZF1, IKZF2, IKZF3, IL7R, JAK1, JAK2, JAK3, KDM6A, KIT, KMT2A, KMT2C, KMT2D, KRAS, LEF1, RUNX1, MPL, MSH6, MYC, NCOR1, NF1, NOTCH1, NOTCH2, NOTCH3, NR3C1, NRAS, NT5C2, NTRK3, PAX5, PDGFRA, PHF6, PIK3CD, PIK3R1, PRPS1, PTEN, PTPN11, RB1, RPL10, RPL22, RUNX1, SETD2, SH2B3, SMARCA4, SMARCC2, STAT1, STAT2, STAT3, STAT5A, STAT5B, TBL1XR1, TCF3, TP53, TSC1, TUSC3, TYK2, U2AF1, UBA2, USH2A, USP7, USP9X, VPREB1, WHSC1, WT1, ZEB2, ZFP36L2
Liquid Solid Tumor Panel
(SNP/indel/fúzió detekció 110 releváns génben)
SNV/indel: AKT1, AKT2, AKT3, ALK, APC, AR, ARAF, ARID1A, ATM, ATR, AURKA, BAP1, BCL2L11, BRAF, BRCA1, BRCA2, CCND1, CCNE1, CD274, CDK12, CDK4, CDK6, CDKN2A, CDKN2B, CREBBP, CTNNB1, DDR2, EGFR, EIF1AX, EPAS1, EPCAM, ERBB2, ERBB3, ERBB4, ESR1, ETS2, FANCA, FBXW7, FGF19, FGF3, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, FLCN, FLT3, GNAS, HIF1A, HRAS, IDH1, IDH2, IGF1R, JAK1, JAK2, JAK3, KDM5C, KDR, KIT, KRAS, MAP2K1, MAPK1, MET, MLH1, MRE11, MSH2, MSH6, MTOR, MYC, NF1, NF2, NOTCH1, NRAS, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PALB2, PAX8, PDCD1, PDGFRA, PGR, PIK3CA, PIK3R1, PMS2, POLD1, POLE, PSMD4, PTCH1, PTEN, RAF1, RASA1, RASAL1, RB1, RET, RICTOR, RIT1, ROS1, RSF1, SF3B1, SMAD4, SMARCA4, SMO, STK11, TERT TOP2A, TP53, TSC1, TSC2, TSHR, VHL
Fúzió: ALK, BRAF, FGFR2, FGFR3. NRG1, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PAX8, RET, ROS1
SNP: ABCB1, C8orf34, CDA, CYP19A1, CYP2D6, DPYD, DYNC2H1, ERCC1, GSTP1, MTHFR, MTRR, SEMA3C, SLC8A3, SOD1, TP53, UGT1A1, UMP3, XPC, XRCC1
Fúziós panel
(507 releváns gén fúzióinak vizsgálata)
GÉNEK LISTÁJA
ABI1, ABL1, ABL2, ACACA, ACE, ACER1, ACKR3, ACSL6, ADD3, AFF1, AFF3, AFF4, AGR3, AHI1, AHRR, ALK, ANKRD28, AR, ARHGAP20, ARHGAP26, ARNT, ASPSCR1, ASTN2, ATF1, ATIC, ATP1B4, AUTS2, BACH2, BAG4, BAIAP2L1, BAZ2A, BCAS3, BCAS4, BCL10, BCL11A, BCL11B, BCL2, BCL2L1, BCL3, BCL6, BCL9, BCOR, BCR, BDNF, BICC1, BIRC3, BIRC6, BRAF, BRD1, BRD3, BRD4, BRWD3, BTBD18, BTG1, C11orf1, C11orf95, C2CD2L, C3orf27, CAMTA1, CAPRIN1, CARS, CASC5, CASP7, CBFA2T3, CBFB, CBL, CCAR2, CCDC28A, CCDC6, CCDC88C, CCNB1IP1, CCNB3, CCND1, CCND2, CCND3, CD74, CDH11, CDK5RAP2, CDK6, CDX1, CDX2, CEBPA, CEBPB, CEBPD, CEBPE, CEP170B, CEP85L, CHD6, CHIC2, CHMP2B, CHST11, CIC, CIITA, CLP1, CLTC, CLTCL1, CMKLR1, CNBP, CNOT2, CNTRL, COG5, COL1A1, COL1A2, COL6A3, COX6C, CPSF6, CRADD, CREB1, CREB3L1, CREB3L2, CREBBP, CRLF2, CRTC1, CSF1, CSF1R, CTDSP2, CTNNB1, CUX1, DAB2IP, DACH1, DACH2, DDIT3, DDX10, DDX20, DEK, DMRT1, DNAJB1, DPM1, DUSP22, DUX4, EBF1, EEFSEC, EGFR, EGR1, EGR2, EGR3, EGR4, EIF4A2, ELF4, ELK4, ELL, ELN, EML1, EML4, EP300, EP400, EPC1, EPOR, EPS15, ERBB3, ERC1, ERCC1, ERG, ERLIN2, ESR1, ETS1, ETV1, ETV4, ETV5, ETV6, EWSR1, EZR, FAM19A2, FCGR2B, FCRL4, FEN1, FEV, FGF8, FGFR1, FGFR1OP, FGFR1OP2, FGFR2, FGFR3, FGFR4, FHIT, FIP1L1, FLI1, FLNA, FLT3, FLT3LG, FNBP1, FOSB, FOSL1, FOXO1, FOXO4, FOXP1, FRK, FRYL, FUS, GAS5, GAS7, GATA1, GIT2, GLI1, GOSR1, GOT1, GPR128, GPR34, GRHPR, GRID1, GTF2I, H2AFX, HAS2, HEY1, HHEX, HIP1, HIPK1, HIST1H4I, HLF, HMGA2, HNF1A, HOXA10, HOXA11, HOXA13, HOXA9, HOXC11, HOXC13, HOXD11, HOXD13, HSP90AA1, ID4, IKZF1, IL2, IL21R, IL3, INPP5D, IQCG, IRF2BP2, IRF4, IRS4, ITK, JAK1, JAK2, JAZF1, KANK1, KAT6A, KAT6B, KDM5A, KIAA1524, KIF5B, KMT2A, KPNB1, KSR1, LASP1, LCK, LCP1, LGR5, LHFP, LHX2, LHX4, LINC00598, LINC00982, LMBRD1, LMO1, LMO2, LNP1, LPP, LPXN, LRMP, LRRC37B, LTBP1, LYL1, MACROD1, MAF, MAFB, MALT1, MAML2, MAPRE1, MBNL1, MBTD1, MDS2, MEAF6, MECOM, MGEA5, MKL1, MKL2, MLF1, MLLT1, MLLT10, MLLT11, MLLT3, MLLT4, MLLT6, MN1, MNX1, MSI2, MSN, MUC1, MUTYH, MYB, MYBL1, MYC, MYH11, MYH9, MYO18A, MYO1F, NAB2, NAPA, NBEAP1, NBR1, NCOA1, NCOA2, NCOA3, NDE1, NF1, NFATC2, NFIB, NGF, NGFR, NIN, NIPBL, NKX2-5, NONO, NOTCH1, NPM1, NR4A3, NR6A1, NSD1, NT5C2, NTF3, NTF4, NTRK1, NTRK2, NTRK3, NUMA1, NUP107, NUP214, NUP98, NUTM1, NUTM2A, NUTM2B, OFD1, OLIG2, OLR1, OMD, P2RY8, PAPPA, PATZ1, PAX3, PAX5, PAX7, PAX8, PBX1, PCM1, PDE4DIP, PDGFB, PDGFRA, PDGFRB, PER1, PHF1, PHF23, PICALM, PIM1, PLAG1, PML, POM121, POU2AF1, POU5F1, PPAP2B, PPARG, PPARGC1A, PPFIBP1, PPP2R1B, PRCC, PRDM16, PRKACA, PRKAR1A, PRKG2, PRRX2, PSIP1, PSMD2, PTPRR, PVT1, RABEP1, RAD51B, RAF1, RANBP2, RAP1GDS1, RARA, RBM15, RBM6, RCOR1, RCSD1, RET, RHOH, RNF213, ROS1, RPL22, RPN1, RREB1, RRM1, RTEL1, RUNX1, RUNX1T1, SARNP, SEC31A, SEPT2, SEPT5, SEPT6, SEPT9, SERPINE1, SERPINF1, SET, SETBP1, SFPQ, SH3D19, SH3GL1, SIK3, SLC34A2, SLC45A3, SLCO1B3, SMAP1, SMARCA5, SMARCB1, SNHG5, SORBS2, SORT1, SP3, SPECC1, SPTBN1, SQSTM1, SRF, SRSF3, SS18, SS18L1, SSBP2, SSX1, SSX2, SSX4, ST6GAL1, STAT5B, STAT6, STRN, SUGP2, SUZ12, SYK, TACC1, TACC2, TACC3, TAF15, TAL1, TAL2, TAOK1, TBX15, TCF12, TCF3, TCL1A, TCTA, TEAD1, TEAD2, TEAD3, TEAD4, TEC, TENM1, TET1, TFE3, TFG, TFPT, TFRC, TGFBR3, THADA, THRAP3, TIRAP, TLX1, TLX3, TMPRSS2, TNFRSF17, TOP1, TOP2B, TP53BP1, TPM3, TPM4, TRHDE, TRIM24, TRIP11, TRPS1, USP16, USP42, USP6, VGLL3, WASF2, WDR18, WDR70, WHSC1, WHSC1L1, WSB1, WT1, WWTR1, XIAP, YAP1, YTHDF2, YWHAE, ZBTB16, ZC3H7A, ZC3H7B, ZFP64, ZFPM2, ZFYVE19, ZMIZ1, ZMYM2, ZMYND11, ZNF207, ZNF384, ZNF444, ZNF521, ZNF585B, ZNF687, NA, NA