Az Ion Torrent Genexus rendszer a teljes NGS munkafolyamatot automatizálja a laboratóriumban, a biológiai mintától egészen a végső jegyzőkönyv kiadásáig. A rendszer jelentősen növeli a szekvenálási vizsgálatok hatékonyságát azáltal, hogy automatizálja a minta- és könyvtárkészítést, a szekvenálást, valamint az adatok elemzését és jelentését. A Genexus Purification System és a Genexus Integrated Sequencer a Genexus szoftverrel szoros egységben, zökkenőmentesen működik együtt, a folyamat során pedig automatikusan nyomon követi a mintainformációkat és az eredményeket.